Masrur, Harissudin (2017) Analisis mutasi pada gen Cyt. oksidase sub-unit II Tarsius Tarsier form Buton sebagai bahan pengembangan buku suplemen genetika di Program Studi Pendidikan Biologi Universitas Jember / Harissudin Masrur. Masters thesis, Universitas Negeri Malang.
Full text not available from this repository.Abstract
ABSTRAK Masrur H. 2017. Analisis Mutasi pada Gen Cyt. Oksidase Sub-unit II Tarsius tarsier Form Buton Sebagai Bahan Pengembangan Buku Suplemen Genetika di Program Studi Pendidikan Biologi Universitas Jember. Tesis. Program Studi Pendidikan Biologi Pascasarjana Universitas Negeri Malang. Pembimbing (1) Prof. Dr. A. Duran Corebima. (2) Dr. Abdul Gofur M.Si. Kata kunci Tarsius gen COX2 mutasi buku suplemen Sulawesi memiliki spesies yang dilindungi yaitu Tarsius (Tarsius tarsier) tersebar di daratan Sulawesi maupun di pulau-pulau yang mengitarinya salah satunya adalah Pulau Buton. Masih relatif sedikitnya informasi tentang T. tarsier membuat peneliti tertarik untuk meneliti khususnya dalam bidang molekuler. Hasil dari penelitian molekuler dapat dikembangkan menjadi buku suplemen berbasis penelitian. Tujuan dari penelitian ini adalah menganalisis mutasi yang terjadi pada sekuen parsial gen cyt. oksidase sub-unit II (COX2) T. tarsier form Buton serta pengembangan buku suplemen genetika mutasi berbasis penelitian di Universitas Jember. Jenis penelitian ini adalah deskriptif eksploratif dan pengembangan. Sekuensing produk PCR menggunakan primer COX2F dan COXR menghasilkan urutan basa sepanjang 560 nt. Hasil sekuensing gen parsial COX2 selanjutnya dijajarkan berganda dengan gen tarsius lain dari Genebank yaitu T. dentatus T. wallacei T. lariang C. bancanus dan C. syrichta dengan bantuan software Clustal-W dan dianalisis dengan bantuan software Mega 7.0 dan DNAsp5. Berdasarkan hasil analisis dapat diketahui bahwa jumlah situs invariabel adalah 406 situs variabel 154 dan total mutasi adalah 165. Mutasi substitusi pada tiap kodon ditemukan di 128 situs dengan jumlah mutasi transisi 103 mutasi transversi 16. Penghitungan jenis substitusi tersebut diperoleh dengan mengabaikan substitusi-tunggal ganda pada situs yang sama. Tingginya laju mutasi transisi dibanding transversi pada gen COX2 menandakan bahwa terdapat peningkatan tekanan mutasi. Tingginya laju mutasi transisi umum terjadi pada sekuen mtDNA eutharian. Sebagian besar Mutasi substitusi di sekuen gen COX2 terjadi pada basa ketiga tiap kodon dimana sebagian besar termasuk mutasi silent. Buku suplemen yang dikembangkan merupakan buku suplemen yang berbasis penelitian dengan model pengembangan R D Borg and Gall. Buku suplemen divalidasi oleh ahli materi ahli pengembangan dan diuji coba pada kelompok kecil dengan 15 mahasiswa. Hasil validasi materi menunjukkan nilai 81 39% validasi pengembangan buku 97 96% dan hasil uji keterbacaan 73 66%. Secara keseluruhan buku yang dikembangkan dalam kategori valid dan cukup valid dengan sedikit revisi. Revisi buku dilakukan berdasarkan saran dan komentar yang diberikan oleh validator dan mahasiswa uji coba kelompok kecil. ABSTRACT Masrur H. 2017. The Analysis of Mutation on Cyt. Oxidase Sub-unit II (COX2) Gene of Tarsius tarsier Form Buton as Source of Developing for Genetics Suplementary Book at Biology Education Program in Jember University. Thesis. Biology education departmen graduate state university of malang. Supervisors (1) Prof. Dr. A. Duran Corebima. (2) Dr. Abdul Gofur M.Si. Sulawesi has a protected species tarsius (Tarsius tarsier) spread on the mainland of Sulawesi as well as on the surrounding islands one of them is Buton. Still relatively little information about T. tarsier makes many researchers interested in especially in the field of molecular. The results of molecular research can be developed into a research-based supplementary book. The purpose of this study is to analyze the mutations which occur in the partial sequence of genes cyt. oxidase sub-unit II (COX2) T. tarsier form Buton as well as the developing of a research-based suplementary book of genetic mutation book at Jember University. The kind of this research is descriptive explorative and development. PCR product sequencing using COX2F and COXR primers yields base sequence of 560 nt. The results of the partial gene sequences of COX2 are aligned with other genes of tarsius from Genebank namely T. dentatus T. wallacei T. lariang C. bancanus and C. syrichta with help of software Clustal-W and analyzed with Mega 7.0 and DNAsp5. Based on the results of the analysis it can be seen that the number of invariable sites 406 the site variable 154 and the total mutation 165. Substitution mutation at each codon is found in 128 sites with 103 transitions 16 transversions. Calculation of substitution type is obtained by ignoring Single-double substitution on the same site. The higher rate of transition mutation than transversion in the COX2 gene indicates that there is mutation pressure. The high rate of transition mutations commonly occurs in the eutharian mtDNA sequence. Most of the substitutionary mutations in the COX2 gene sequences occur in the third base of each codon which is almost being silent mutation. The supplementary book which was being developed is a research-based supplementary book with development model R D Borg and Gall. The supplementary book was validated by a material expert a development expert and tested on a small group of 15 students. The result of material validation showed the value of 81 39% developing validation 97 96% and the result of reading test 73 66%. Overall the supplementary book is valid enough with a little revision. The revised book is based on suggestions and comments provided by validators and test of small group of students.
| Item Type: | Thesis (Masters) |
|---|---|
| Subjects: | L Education > L Education (General) |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan IPA (FMIPA) > Departemen Biologi (BIO) > S2 Pendidikan Biologi |
| Depositing User: | library UM |
| Date Deposited: | 10 Jul 2017 04:29 |
| Last Modified: | 09 Sep 2017 03:00 |
| URI: | http://repository.um.ac.id/id/eprint/60707 |
Actions (login required)
 |
View Item |