Manggabarani, Andi Madihah (2013) Isolasi fragmen bagian depan dan tengah kedua gen Acyltransferase (AT3) dari Capsicum frutescens L. cv. Cakra Hijau / Andi Madihah Manggabarani. Diploma thesis, Universitas Negeri Malang.
Full text not available from this repository.Abstract
Manggabarani Andi Madihah. 2013. Isolasi Fragmen Bagian Depan dan Tengah kedua Gen Acyltransferase (AT3) dari Capsicum Frutescens L. cv. Cakra Hijau. Skripsi Jurusan Biologi Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Negeri Malang. Pembimbing (I) Dra. Eko Sri Sulasmi M.S. dan (II) Dra. Dwi Listyorini M.Si. D.Sc. Kata kunci Capsicum frutescens cv. Cakra Hijau kapsaisin gen AT3 Capsicum frutescens cv. Cakra Hijau merupakan cabai kultivar lokal yang banyak dibudidayakan di Indonesia karena beberapa keunggulan yang dimilikinya. Rasa pedas pada Capsicum disebabkan oleh senyawa kapsaisin yang dikode oleh gen AT3. Sepanjang 404 bp bagian tengah pertama dari sekuen gen AT3 C. frutescens cv. Cakra Hijau telah berhasil diisolasi. Penelitian ini bertujuan mengisolasi bagian depan dan tengah kedua dari sekuen gen AT3. Gen AT3 diisolasi dengan metode PCR menggunakan primer F2/R2 (F2 5 -TCT CCA TGC TGA CAA CAA CA-3 dan R2 5 -CGA TGA AAG ATA GCT TGT G-3 ) untuk membaca sekuen bagian depan dan primer F3/R3 (F3 5 -GCA TCT CTT GCA GAG AGC ATA G-3 dan R3 5 -TGT ACG CAC TCG TTG AGA CT-3 ) untuk membaca sekuen bagian tengah pertama. Sekuen yang teramplifikasi menggunakan primer F2/R2 diperoleh sepanjang 326 basa dan primer F3/R3 diperoleh sepanjang 261 basa. Hasil penggabungan fragmen F2/R2 F3/R3 dan fragmen tengah pertama menghasilkan sekuen parsial sepanjang 905 basa. Hasil analisis sekuen nukleotida dengan BLAST menunjukkan bahwa sekuen parsial yang telah diperoleh memiliki tingkat similaritas sebesar 99% dengan gen pembanding (gen AT3 C. frutescens cv. Shuanla dan C. frutescens cv. BG2814-6) dan hasil pensejajaran dengan ClustalX menunjukkan bahwa seluruh sekuen fragmen parsial yang telah diperoleh adalah sekitar separuh bagian depan. Rancangan primer selanjutnya diperlukan agar dapat diperoleh fragmen AT3 pada bagian akhir sepanjang 972 bp berdasarkan perbandingan dengan C. frutescens cv. Shuanla.
| Item Type: | Thesis (Diploma) |
|---|---|
| Subjects: | ?? ?? |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan IPA (FMIPA) > Departemen Biologi (BIO) > S1 Biologi |
| Depositing User: | library UM |
| Date Deposited: | 02 Oct 2013 04:29 |
| Last Modified: | 09 Sep 2013 03:00 |
| URI: | http://repository.um.ac.id/id/eprint/26535 |
Actions (login required)
 |
View Item |