Purwodrminto, Yuswo (2019) Analisis potensi senyawa asam galat dalam teh(cameliasinensis ) sebagai neuroprotective melalui metode protein target prediction dengan teknik virtual docking / Yuswo Purwodrminto. Diploma thesis, Universitas Negeri Malang.
Full text not available from this repository.Abstract
Neuroprotektif merupakan topik yang sering digunakan dalam penelitian kesehatan karena berhubungan dengan neurodegeneratif atau kerusakan saraf. Alzheimer dan Parkinson adalah penyakit yang disebabkan oleh neurodegeneratif. Belum ada obat khusus untuk penanganan penyakit neurodegeneratif. Penanganan gejala neurologic lain seperti kejang diatasi dengan menggunakan obat acetazolamide. Namun penggunaan obat pereda gejala neurologic masih belum efektif karena dapat menimbulkan ketergantungan karena penggunaannya harus secara terus menerus. Salah satu solusi untuk menghindari efek obat kimia ialah menggunakan bahan alam. Camelia sinensis (tanaman teh) merupakan tanaman yang termasuk dalam famili Theaceae yang sering digunakan sebagai tanaman obat karena memiliki berbagai senyawa bioaktif. Sejumlah asam fenol yang sering dijumpai pada tanaman antara lain asam ferulic asam ellagic asam caffeic dan asam galat. Asam galat merupakan asam fenol yang paling menjanjikan sebagai senyawa bioaktif karena banyak ditemukan pada berbagai tanaman termasuk teh. Asam galat memiliki gugus fenol yang menjadi sumber atom hidrogen untuk mengurangi kadar radikal bebas. Prediksi potensi senyawa sebagai neuroprotektor dapat dilakukan dengan melakukan pendekatan in silico. Pendekatan in silico merupakan penelitian yang mengusahakan simulasi kondisi yang sebenarnya hal ini dimaksudkan untuk efisiensi biaya serta kondisi tertentu yang tidak bisa dilakukan secara in vivo. Untuk menjelaskan potensi senyawa dalam teh perlu dilakukan penelitian in silico melalui metode protein target prediction dengan virtual docking untuk memprediksi potensi senyawa sebagai neuroprotective. Jenis penelitian ini ialah deskripstif kuantitatif dan kualitatif dengan pendekatan in silico. Data kuantitatif dan kualitatif pada penelitian ini digunakan untuk memprediksi potensi senyawa Asam galat dalam mengatasi gejala Neuroprotective. Analisis senyawa Asam galat menggunakan metode penelitian protein target prediction yaitu metode yang digunakan untuk menentukan protein target suatu senyawa melalui webserver dengan cara menginput stuktur virtual senyawa pada webserver. Webserver yang digunakan pada penelitian ini ialah Swiss Target Prediction. Tahap selanjutnya ialah melakukan virtual docking untuk menentukan sisi ikat antara senyawa dengan protein target serta memvisualisasikannya. Hasil penelitian metode protein target prediction dan virtual docking menunjukkan bahwa Asam gallic berpotensi untuk neuroprotective dengan cara menghambat kerja enzim CA1. Hal ini ditunjukkan dengan persamaan residu asam amino sisi ikat senyawa Asam gallic terhadap CA1 bila dibandingkan dengan dengan senyawa kontrol Acetaazolamide (SER A231) Ethinamate (HIS A243 GLN A24 dan SER A231) dan Zonisamide (HIS A243 GLN A24 dan SER A231). Binding afinitas Asam gallic lebih baik dibandingkan dengan Ethinamate karena hanya membutuhkan energi -5 9 kcal/mol untuk berikatan dengan protein target sedangkan Ethinamate memerlukan -5 8 kcal/mol. Asam gallic memiliki nilai bindng afinitas lebih kecil daripada Acetazolamide dan Zonisamide yang hanya membutuhkan -6 1 dan -6 0 kcal/mol untuk berikatan dengan CA1. Asam gallic memiliki potensi secara biooral karena memenuhi lima prinsip Lipinski yaitu berat molekul sebesar 169 112 dalton donor ikatan H sebanyak 3 dan akseptor ikatan H sebanyak 5 logP sebesar 0 59 dan rotatable bond sebanyak satu.
Item Type: | Thesis (Diploma) |
---|---|
Subjects: | ?? ?? |
Divisions: | Fakultas Matematika dan IPA (FMIPA) > Departemen Biologi (BIO) > S1 Biologi |
Depositing User: | library UM |
Date Deposited: | 29 Nov 2019 04:29 |
Last Modified: | 09 Sep 2019 03:00 |
URI: | http://repository.um.ac.id/id/eprint/215536 |
Actions (login required)
View Item |