Ananda, Honesty Rizkia (2025) Identifikasi mutasi gen wnt5a dan analisis interaksi dengan reseptor fzd dengan pendekatan bioinformatika berdasarkan database gen / Honesty Rizkia Ananda</p>. Diploma thesis, Universitas Negeri Malang.
Full text not available from this repository.Abstract
Kanker merupakan penyakit akibat pertumbuhan sel abnormal yang tidak terkendali dan menjadi penyebab kematian kedua terbanyak di dunia. Berdasarkan Riskesdas prevalensi tumor/kanker di Indonesia meningkat dari 1 4 per 1000 penduduk (2013) menjadi 1 79 per 1000 (2018). Salah satu jalur pensinyalan yang terlibat dalam kanker payudara adalah Wnt khususnya Wnt5a yang berperan dalam proliferasi migrasi dan invasi sel. Mutasi pada gen Wnt5a diketahui dapat mengganggu fungsi pensinyalan dan berkontribusi terhadap perkembangan kanker. Mutasi pada Wnt5a diduga mempengaruhi afinitas pengikatan terhadap reseptor Fzd sehingga dapat mengubah kekuatan interaksi dan memicu aktivasi jalur pensinyalan abnormal yang berkontribusi terhadap perkembangan tumor. Oleh karena itu analisis perbandingan antara Wnt5a Wild type dan varian mutan melalui pendekatan bioinformatika dan molecular docking menjadi penting untuk memahami dampak perubahan struktur molekul terhadap interaksi ligan ndash reseptor. Penelitian ini bertujuan untuk memodelkan interaksi tersebut dan memprediksi kekuatan ikatan berdasarkan nilai binding affinity guna mengidentifikasi potensi pengaruh mutasi terhadap aktivitas biologis Wnt5a. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat beberapa variasi struktural pada protein Wnt5a. Sampel EF028086.1 menunjukkan delesi besar dan menghasilkan isoform pendek sedangkan AK290375.1 BC064694.1 dan NM003392.7 merupakan isoform A yang memiliki tambahan 15 asam amino di ujung amina. Sebaliknya sampel seperti BC074783.2 dan tiga cDNA synthetic merupakan isoform B yang strukturnya sejajar dengan wild type. Hasil docking menunjukkan bahwa struktur protein sangat memengaruhi kekuatan interaksi dengan Fzd. Wnt5a yang mengalami delesi memiliki nilai binding affinity paling rendah menandakan ikatan yang paling kuat. Sementara itu isoform b memiliki nilai binding affinity paling tinggi menunjukkan interaksi yang paling lemah. Berdasarkan hasil tersebut mutasi dan variasi isoform pada Wnt5a menyebabkan perubahan struktur protein yang signifikan sehingga memengaruhi kekuatan dan posisi interaksi dengan reseptor Fzd. Wnt5a dengan struktur terdelesi menunjukkan interaksi paling kuat sedangkan isoform b yang merupakan representasi struktur wild type justru menunjukkan interaksi paling lemah. Hal ini menunjukkan bahwa perubahan struktural pada Wnt5a akibat mutasi dapat berkontribusi pada progresivitas kanker payudara melalui perubahan dalam jalur pensinyalan Wnt.
| Item Type: | Thesis (Diploma) |
|---|---|
| Divisions: | Fakultas Matematika dan IPA (FMIPA) > Departemen Biologi (BIO) > S1 Bioteknologi |
| Depositing User: | library UM |
| Date Deposited: | 29 Oct 2025 04:29 |
| Last Modified: | 09 Sep 2025 03:00 |
| URI: | http://repository.um.ac.id/id/eprint/422547 |
Actions (login required)
 |
View Item |