Faqih, Khoirul (2018) Skrining turunan flavonod sebagai inhibitor protease NSP2 dari virus chikungunya menggunakan molecular docking / Khoirul Faqih. Diploma thesis, Universitas Negeri Malang.
Full text not available from this repository.Abstract
vii RINGKASAN Faqih Khoirul. 2018. Skrining Turunan Flavonoid sebagai Kandidat Inhibitor Protease nsP2 dari Virus Chikungunya menggunakan Molecular Docking. Skripsi Jurusan Kimia Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Universitas Negeri Malang. Pembimbing (I) Dr. Yahmin S.Pd. M.Si. (II) Dr. Suharti S.Pd. M.Si. Kata Kunci flavonoid protease nsP2 virus chikungunya molecular docking Protease nsP2 dari virus chikungunya merupakan salah satu protein non struktural. Protein non struktural memainkan peranan penting dalam replikasi virus chikungunya. Hal tersebut menjadikan protease nsP2 berpotensi sebagai target yang harus diinhibisi karena peranannya yang sangat penting dalam replikasi genom dari virus chikungunya. Inhibisi protease nsP2 akan menghambat perkembangbiakan virus yang berakibat pada pemutusan siklus hidup virus. Salah satu senyawa yang berpotensi sebagai inhibitor adalah senyawa turunan flavonoid. Senyawa turunan flavonoid dipilih sebagai inhibitor karena telah terbukti sebagai antivirus untuk virus influenza herpes dan demam berdarah. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan senyawa turunan flavonoid yang berpotensi sebagai inhibitor protease nsP2 dari virus chikungunya dengan metode molecular docking dan mengkaji interaksi apa saja yang terjadi antara senyawa turunan flavonoid hasil skrining dengan protease nsP2 dari virus chikungunya. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif kualitatif dengan cara membandingkan nilai binding affinity hasil molecular docking dan visualisasi molekul antara senyawa turunan flavonoid dengan protease nsP2 dari virus chikungunya. Rancangan dalam penelitian ini diawali dengan tahap studi literatur yang relevan. Molecular docking dilakukan dengan software PyRx 0.8. Senyawa kelompok flavonoid yang diuji terdiri dari enam kelompok yaitu flavon flavonol isoflavonoid flavanon kalkon dan antosianin yang berpotensi sebagai inhibitor protease nsP2 dari virus chikungunya. Dari enam kelompok flvanoid tersebut diambil empat senyawa berdasarkan nilai binding affinity terbaik. Masing-masing senyawa tersebut yaitu sianidin kation delpinidin malvidin peonidin arbutin kalkon naringenin phloretin phlorizin baicalein galangin luteolin rhoifolin kaempferol myricetin quersetin rutin hesperidin hesperitin naringenin naringin daidzin genistein genistin dan glisitein. Visualisasi molekul hasil proses molecular docking dengan software Edu PyMOL LIGPLOT dan Dicsovery Studio digunakan untuk mengkaji interaksi apa saja yang terjadi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa setelah melalui proses molecular docking menggunakan software PyRx 0.8 senyawa turunan flavonoid yang berpotensi sebagai inhibitor dari enam kelompok flavonoid yaitu hesperidin rhoifolin myricetin genistin peonidin phlorizin yang mempunyai nilai root means square deviation (RMSD) senilai 0 8491 dengan nilai binding affinity berturut-turut -9 4 -8 5 -8 1 -7 9 -7 6 dan -6 9 kkal/mol. Hasil visualisasi molekul menggunakan software Edu PyMOL LIGPLOT dan Dicsovery Studio secara umum menunjukkan terjadinya interaksi hidrofobik dan terbentuknya ikatan viii hidrogen. Berdasarkan hal tersebut dapat disimpulkan bahwa hesperidin yang merupakan golongan flavanon memiliki potensi yang lebih dari senyawa golongan flavonoid yang lain dengan nilai binding affinity sebesar -9 4 kkal/mol.
| Item Type: | Thesis (Diploma) |
|---|---|
| Subjects: | Q Science > QD Chemistry |
| Divisions: | Fakultas Matematika dan IPA (FMIPA) > Departemen Kimia (KIM) > S1 Kimia |
| Depositing User: | Users 2 not found. |
| Date Deposited: | 23 Aug 2018 04:29 |
| Last Modified: | 09 Sep 2018 03:00 |
| URI: | http://repository.um.ac.id/id/eprint/24011 |
Actions (login required)
 |
View Item |