Identifikasi spesies isolat bakteri bacillus cereus group dari Ranu Pani Jawa Timur berdasarkan gen pycA / Mohammad Fatikunnaja - Repositori Universitas Negeri Malang

Identifikasi spesies isolat bakteri bacillus cereus group dari Ranu Pani Jawa Timur berdasarkan gen pycA / Mohammad Fatikunnaja

Fatikunnaja, Mohammad (2021) Identifikasi spesies isolat bakteri bacillus cereus group dari Ranu Pani Jawa Timur berdasarkan gen pycA / Mohammad Fatikunnaja. Diploma thesis, Universitas Negeri Malang.

Full text not available from this repository.

Abstract

Identifikasi bakteri Bacillus cereus group yang memiliki potensi penambat nitrogen (B2) penghasil Indole-3-Asetic Acid (IAA) (PIS) dan selulolitik (PSS) dari Ranu Pani berdasarkan gen 16S rRNA telah dilakukan pada penelitian sebelumnya dan belum berhasil menentukan spesies dari bakteri-bakteri tersebut. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi spesies isolat bakteri tersebut berdasarkan gen pycA. Penelitian ini dilakukan dengan mengisolasi DNA bakteri selanjutnya mengamplifikasi sekuens gen pycA menggunakan primer forward pycA-F (5 -GCG TTA GGT GGA AAC GAA AG-3 ) dan primer reverse pyc-R (5 -CGC GTC CAA GTT TAT GGA AT-3 ). Amplikon sekuens gen target disekuensing di 1st BASE Laboratories Malaysia. Analisis filogenetik serta jarak genetik dilakukan menggunakan softwere MEGA-X. Berdasarkan hasil rekonstruksi pohon filogenetik dan analisis jarak genetik sampel B2 dan PIS diduga adalah spesies Bacillus cereus Bacillus thuringiensis atau Bacillus anthracis (jarak genetik 0.004). Sampel PSS diduga adalah spesies Bacillus cereus atau Bacillus tropicus (jarak genetik 0.002). Gen pycA memiliki tingkat diskriminasi spesies lebih kuat dibandingkan dengan gen 16S rRNA namun spesies isolat B2 PIS dan PSS masih bias. Perlu dilakukan identifikasi lebih lanjut menggunakan gen spesifik lain sehingga dapat diketahui spesies sampel secara tepat.

Item Type: Thesis (Diploma)
Subjects: ?? ??
Divisions: Fakultas Matematika dan IPA (FMIPA) > Departemen Biologi (BIO) > S1 Biologi
Depositing User: Users 2 not found.
Date Deposited: 01 Nov 2021 04:29
Last Modified: 09 Sep 2021 03:00
URI: http://repository.um.ac.id/id/eprint/192516

Actions (login required)

View Item View Item